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超聲破碎儀

DNA片段制備

  • NGS樣品庫制備

  • CHIP片段制備

  • 細胞亞結構提取


聯系人:文女士
電話:0755-26410427
郵箱:equipment@dakewe.com


  • 請填寫標題

產品介紹

原理:

Digital Adaptive Sonocavitation(DAS)技術即“數字式自適應超聲空化”技術,是指通過壓電轉換器,將數字式電信號,轉變為高頻聲波信號,產生數百萬的水分子“空穴”,在幾微秒內“空穴”變大、破碎產生扭曲物理力打斷生物大分子。




技術對比:

 

1)EpiSonic? 1100采用淺盤式水槽,底盤超聲發生器大,超聲波基本呈直線往上達到樣本,樣本受超聲機械能均一,能量損失少,能承載1-96個樣本

2)Competitor D 深桶式水槽設計,超聲機械能Breitling Superocean Replica Replica Hublot Large Bang Depeche Mode Replica Montblanc Nicolas Rieusse Panerai Ferrari Replica Watches 通過直線或者桶壁反射到達樣本,能量損失多,受力均一性差,承載小樣本數有限(最多12個)

3)Competitor C 高頻聚焦超聲技術,采用特制的聚焦式超聲發生器,聚焦點只有一個,采用特制的樣品管,昂貴而且一次只能放一個;另外瞬間能量非常高,導致樣品升溫非常嚴重


溫控:

在超聲破碎的過程中,對樣品的溫度控制,是防止樣品過熱,得到高重復性、高一致性結果的關鍵措施。
1)  采用直線式超聲淺盤設計,EpiSonic? 1100每個樣品管承載的能量為0.1W(低于其他產品的承載能量)
2)采用循環水冷卻系統,通過冷卻裝置將樣品槽內多余熱量,

迅速由外周水槽流走,同時淺盤設計比深桶設計利于冷水循環
3)采用DASTM技術,外周水槽中的水處于急速湍流狀態,利于熱量從樣品傳導到外周水槽


應用:

1、為DNA測序、CHIP提供優質的文庫:
EpiSonic? 1100為DNA測序、ChIP精準提供所需大小的片段,具有高樣品得率、重復性和一致性,可自動地、按預定程序快速處理96孔PCR板或標準實驗管。
2、可與多種NGS分析平臺兼容:
EpiSonic? 1100可以將2000bp以下的DNA剪切成高質量的、含有下一代測序
所需的DNA文庫的片段,可與多種NGS分析平臺兼容:lllumina Genome Analyzer,
lllumina Hiseq,lllumina Miseq,Roche 454 Sequencing GS FLX,Roche 454
Sequencing GS Junior,Life Technologies SOLiD System,Life Technologies Ion Torrent等
3、可與多種ChIP分析

平臺兼容:
EpiSonic? 1100是一款最理想的設備,可產生用于ChIP的200-600bp的片段,可與多種ChIP分析平臺兼容:ChIP-PCR/qPCR,ChIP-chip,ChIP-Seq等。
4、精確性高、一致性好、重復性好:
DNA在不同超聲持續時間內被精確剪切成不同大小的片段;將同一細胞的不同樣本并行處理后,所得到的剪切片段大小基本一致;相同的樣品分批處理后,所得到的平均片段大小基本相同 

       

                              A                                  B                                                 A                                  B
                                                 Fig.1                                                                            Fig.2

 Fig.1 Demonstration of precise DNA shearing of different sizes.3μg of placental DNA in 0.2 ml tubes were sheared with the EpiSonicTM 1100 at different sonication durations(10,15,20,45,and 62.5 min).The resulting lengths of the sheared DNA were analyzed with an Agilent Bioanalyzer 2100 [A] and an agarose gel [B].

Fig.2 Demonstration of Sample-to-Sample Consistency.2μg of placental DNA in 30μl buffer were placed in well positions B2,B6,D6,E7,F9,and G11 of a 96-well PCR plate and sheared with the EpiSonicTM 1100 for 40 cycles [A] and then repeated in a subsequent run with the exact same conditions [B].

Fig.3 Demonstration of high reproducibility. 3μg sample of placental DNA (30μl ) in the different wells of a 96-well plate was sheared with the EpiSonicTM 1100 for 40 cycles.The resulting lengths of the sheared DNA were analyzed with an Agilent Bioanalyzer 2100. Average sheared DNA size is 380.4 bps for the first run [A] and is 379.2bps for the next run [B].The two Bioanalyzer imagas were then overlapped to visualize the high reproducibility [C]. The CV% of sample to sample in the same run is 1.1 to 4.7% and is 0.3% between the different runs .Average percentage of dsDNA recovered from 10 samples is 75.2%.


設備介紹:

EpiSonic? 1100系統主要包括三個部分:超聲波發生器、冷卻系統、樣品臺。
 

    超聲波發生器                                 樣品臺                       循環水冷卻系統    


超聲波發生器
通過操作 超聲波發生器控制面板,將電信號通過超聲波轉換器轉換成聲波信號,傳入樣品室,
破碎樣品,該部分具有以下優點:
觸屏控制:簡單、直觀的菜單導航
高精確度:數字式調整所有的設置
實時能量、溫度監測:儀器屏幕可顯示振幅、瓦特、焦耳讀數及樣品槽內的溫度等
自動超載保護:監測故障,出現故障時可關閉系統              以防止損壞電路
可編程序存儲器:可儲存10個程序,按屏幕的數字鍵即可選擇、調用相應程序

樣品臺
可放置標準0.2ml PCR管、半裙管或者96孔PCR板、1.5ml的樣品管
密閉容器處理:密閉的管/孔的非接觸超聲波處理,可以防止樣品污染和降解 
生物安全性:沒有氣霧產生,不用繁瑣的操作探針,提高了安全性

循環水冷卻系統
通過冷卻器將樣品室內多余熱量,通過輸水管迅速由外周水槽流走


產品參數:

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